时间:2026-10-26 05:32:14来源:
BLASTP是用于蛋白质序列比对的常用工具,适用于查找相似蛋白序列。以下是其基本使用方法和参数说明。
| 参数 | 说明 |
| -query | 输入蛋白质序列文件 |
| -db | 指定数据库名称(如nr) |
| -out | 输出结果文件名 |
| -evalue | 设置期望值阈值(默认10) |
| -num_alignments | 返回的匹配数(默认50) |
| -outfmt | 输出格式(如“6”为简明格式) |
使用命令:`blastp -query seq.fasta -db nr -out result.txt -evalue 1e-5 -num_alignments 10 -outfmt 6`
建议根据需求调整参数,确保结果准确且高效。